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Reunião Anual Conjunta dos Grupos de Estudo de Cirurgia Cardíaca, Doenças Valvulares e Ecocardiografia da SPC
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CLEAR FILTERS
Interação gene-gene na cardiopatia isquémica por MDR: Para além da regressão logística
Session:
Posters 2 - Écran 03 - Ciência Básica
Speaker:
Andreia Pereira
Congress:
CPC 2018
Topic:
O. Basic Science
Theme:
36. Basic Science
Subtheme:
36.3 Basic Science - Cardiac Diseases
Session Type:
Posters
FP Number:
---
Authors:
Andreia Pereira; Roberto Palma dos Reis; Adriano Sousa; Joel Monteiro; Micaela Rodrigues Neto; Ana Célia Sousa; Sónia Freitas; Mariana Rodrigues; Ana Isabel; Carolina Freitas; Ilídio Ornelas; A. Drumond de Freitas; Maria Isabel Mendonça
Abstract
<p>Introdução: Recentemente, múltiplas variantes genéticas têm sido identificadas como associadas a Cardiopatia isquémica (CI) nos Estudos de Associação genómica. Para melhor analisar a interacção gene-gene novos métodos computacionais e estatísticos surgiram para além da regressão logística clássica.<br /> Objetivos: Estudar, com recurso aos novos métodos “data mining” nomeadamente o Multifactor dimensionality Redution (MDR), o melhor modelo de interacção gene-gene e preditor de doença coronária (DC), entre as variantes genéticas associadas à DC.<br /> Métodos: Foram incluídos 2888 participantes (idade média 53±7,9 anos, 77,8% sexo masculino) dos quais 1566 doentes coronários documentados por angiografia com uma ou mais estenoses epicárdicas superiores a 75% e 1322 controlos selecionados por idade e género. Foi realizada a genotipagem com recurso a técnica Taqman standard (Applied Biosytems). Realizou-se uma análise gene a gene entre 33 variantes genéticas associadas com doença Coronária. Das 10 consideradas significativas previamente utilizou-se o método de data mining (MDR) para obtenção do melhor modelo genético preditor para CI.<br /> Resultados: No modelo com um gene, o MDR projetou o gene TCF21 como o fator de risco genético mais significativo para a DC. O modelo com dois genes demonstrou interação sinérgica entre os genes TCF21 e APOE. O modelo bivariado genético do TCF21 e APOE foi o melhor modelo preditor com um OR de 1,51 (IC95%: 1,29-1,76; p<0,0001) e com adequada validação cruzada (10/10), sem evidência de over fiting do modelo. A acuidade do melhor modelo G-G preditor de DC foi de 0,55. Obteve-se razoável sensibilidade (60%) e razoável especificidade (50%) desse modelo.<br /> Conclusões: Na nossa população a interacção entre as variantes genéticas TCF21 (eixo celular) e APOE (eixo lipídico) demonstrou associação consistente com CI. A ser confirmada, esta interação pode levar à identificação de novos alvos terapêuticos na CI.</p>
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